國家高速網路與計算中心
  國網中心     | 生物化學資料庫服務    
 
 
回首頁    | 好站連結    | SiteMap

 三維影像國際合作

 2005識之精微

 會議展示及參訪

 好站連結
最新消息
NGS分析平台
Olfactory DB
生物知識庫
知識庫服務說明
生技新知 
生物計算服務系統
生物計算服務說明   
生物序列分析     
軟體與資料庫 
結構生物軟體 
生醫影像軟體 
關於我們
認識生物計算小組
台灣生物資訊學會
聯絡我們
 
Bioinformatics Knowledge Database 國網中心生物知識庫與生物計算服務系統: 期刊導讀

在這個主題中搜尋:   
[ 回到首頁 | 選擇新的主題 ]

增進SNP預測的準確性
貼出者為 TerryYeh 於Friday, May 18 @ 11:06:03 CST(1158閱讀)
$topictext 由於建立EST時,會從不同個體中取出相同基因的轉錄副本,所以我們可以利用各種物種EST的大量重複序列進行SNP的偵測。

KEGG提供具反應路徑及EST索引的轉錄體植物資料庫
貼出者為 TerryYeh 於Thursday, May 17 @ 11:49:37 CST(1263閱讀)
$topictext EGENES是一個分析植物EST後產生的知識庫,目前已加入KEGG的資料庫服務。

利用EST資料庫判斷人類內生性反轉錄病毒活性的方法
貼出者為 TerryYeh 於Wednesday, May 16 @ 19:04:02 CST(1460閱讀)
$topictext 古代人類所感染反轉錄病毒的痕跡殘留在人類DNA中,稱為人類內生性反轉錄病毒(HERVs)。

一個處理與探勘EST序列原始圖檔的網頁服務
貼出者為 TerryYeh 於Tuesday, May 15 @ 12:01:41 CST(1435閱讀)
$topictext 表現序列標幟(EST)在辨識許多基因體蛋白編碼部分的研究,仍是一個主要的方法,由於本身的缺點,在資料的品質控制上仍存在許多的挑戰。

豬隻轉錄體學研究現況
貼出者為 TerryYeh 於Monday, May 14 @ 15:13:59 CST(1143閱讀)
$topictext 過去五年豬隻的轉錄體資料增加的十分迅速,目前在GenBank已經有62萬多筆EST資料可供查詢

動態瀏覽及編輯KEGG反應路徑圖譜的工具
貼出者為 TerryYeh 於Wednesday, April 25 @ 17:42:48 CST(1703閱讀)
$topictext   動機:京都基因及基因組百科全書(KEGG)反應路徑資料庫是一個在生命科學領域非常有價值的研究資源,它包含了代謝及調節過程的路線圖,這些資訊不但可以自由瀏覽取得,亦可作為模型或模擬的基礎,因此,它協助我們了解生物系統中的過程與功能。目前,KEGG網站利用半靜態的方式來展現所有的反應路徑資訊,雖然這種展示的方式已經是一種好方法,但並沒有提供任何動態展示的可能性,最重要的是,無法創造使用者自己建置的反應路徑圖形。

一個開放原始碼的化學及生物資訊工作平台
貼出者為 TerryYeh 於Wednesday, March 28 @ 15:20:03 CST(1464閱讀)
$topictext 背景:基於一個完整且具延展性的單一入口化學與生物資訊工具應用軟體的需求,並且商用軟體是非常昂貴又沒有開放原始碼,使得使用者不能改變演算法或增加額外的功能,而現今越來愈多的開放原始碼計畫,都著重在提供一個整合現有,並分開安裝的生物資訊套件的架構,而不僅是一個友善的介面。目前沒有任何開放原始碼的化學資訊工作平台被發表,並且沒有任何成功的整合化學與生物資訊,到單一架構的工作平台出現。

一個簡單又快速的基因體序列組合工具
貼出者為 TerryYeh 於Wednesday, March 28 @ 11:42:46 CST(1575閱讀)
$topictext   背景:由於演算法需要處理大量的全基因體序列,以至於目前的基因體組合工具都成長的相當龐大且複雜。然而許多常用的組合工具都期望能夠以越少的軟體套件,使用越少的記憶體,及簡單的安裝與執行方式,提供給使用者使用。

一個網頁介面的高產量序列比對及分析工具
貼出者為 TerryYeh 於Friday, March 16 @ 12:19:47 CST(1472閱讀)
$topictext 背景:BLAST是一個常用的序列比對軟體,通常用來進行未知序列註解、研究基因模組,或者是兩條序列的比對等功能性或比較性的基因體相關研究,而基因序列定序技術的發展,給了進行大量序列比對分析一個挑戰。許多的程式及硬體架構方便使用者進行序列比對,但是缺乏了一個分析比對結果的軟體,系統性的瀏覽結果及分類依然是使人厭煩及浪費時間的。

一種平行化開發的BLAST序列比對平台
貼出者為 TerryYeh 於Friday, March 16 @ 11:30:23 CST(1369閱讀)
$topictext BLAST是一種普遍用於在大量序列資料庫快速尋找的應用程式,而TurboBLAST是一個將NCBI BLAST架構於電腦叢集上,使得所有比對工作皆可利用多CPU進行比對,他的作法是將每個NCBI BLAST的工作拆散至不同的CPU執行,已求達到最快的速度。

1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  ...  16  
跳至    頁