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細胞網路與反應路徑的電腦鑑別法
貼出者為 TerryYeh 於Tuesday, June 26 @ 10:36:10 CST(1231閱讀)
$topictext 在這篇文章中,研究人員指出近來利用不同的基因體數據,鑑別功能相關基因及蛋白質網路的功能性基因體計算方法的發展

多基因體全序列排比及新的生醫應用
貼出者為 TerryYeh 於Friday, June 15 @ 09:41:47 CST(1380閱讀)
$topictext   比較基因體入口網VISTA是設計來讓生醫科學家有一個統一的工具,可以進行從初始DNA序列比對排比、註解,到視覺化比對的結果,而VISTA入口網已經有許多計算好的基因體排比結果,可以讓使用者直接對其有興趣的部份進行研究,而無需手動下載序列進行分析,在這篇文章中,研究人員也描述了在近兩年中,數種演算法及功能的改進。

利用大幅度演算法進行mRNA與基因體比對
貼出者為 TerryYeh 於Thursday, June 07 @ 11:01:30 CST(1369閱讀)
$topictext   動機:儘管許多年來不斷在進行如何正確的比對具有定序錯誤、另類基因剪接以及微外顯子(micro-exon)序列的研究,將mRNA序列正確的比對到基因體DNA序列,仍然是一個具挑戰性的議題。

一個用來比對小型基因體的網頁工具
貼出者為 TerryYeh 於Friday, June 01 @ 14:19:02 CST(1389閱讀)
$topictext 背景:比較基因體學已經成為鑑定同源基因及其功能的必要方法,並且可以用來研究基因體的演化。目前已經有許多工具可以進行基因體的比較。但不幸的是,大部分的工具不能拿來鑑別單一基因,以及推斷一組基因體的演化親源關係。

一個互動式比較基因體圖譜展示網頁工具
貼出者為 TerryYeh 於Friday, June 01 @ 11:21:28 CST(1452閱讀)
$topictext AutoGRAPH是一個互動式的網頁伺服器,可以讓使用者使用自己的資料或是伺服器提供的資料,自動進行多物種的比較基因體分析

一個靈敏的基因體比對工具
貼出者為 TerryYeh 於Friday, May 25 @ 11:13:46 CST(1236閱讀)
$topictext 動機:隨著基因體序列增加,研究人員打算利用大量的資料來增進基因體比對的品質,並設計一種能夠偵測微弱或是沒有演化限制演化的區域。

用來完成並分析重複區域的序列組合工具
貼出者為 TerryYeh 於Friday, May 25 @ 10:14:53 CST(1328閱讀)
$topictext 背景:許多基因體計畫未完成,都是由於有複雜的重複區域,完成(finishing)是組合序列中最耗時的步驟,目前的完成工具沒有被設計來解決特殊的重複序列問題。

一種快速的基因體規模比對工具
貼出者為 TerryYeh 於Thursday, May 24 @ 11:20:27 CST(1407閱讀)
$topictext 現今的比對方法通常都設計來快速並有效的進行大量資料分析,卻往往喪失了靈敏性,為了克服這一點,研究人員發展了一種新的比對程式-GRAT,可以加速比對短而高度相似的DNA序列

具保留性重組基因體的多序列比對軟體
貼出者為 TerryYeh 於Thursday, May 24 @ 10:48:22 CST(1315閱讀)
$topictext 當基因體陸續被定序,一個不利用短序列進行大規模演化分析的挑戰正逐漸形成。

利用EST序列尋找轉位子
貼出者為 TerryYeh 於Monday, May 21 @ 11:34:03 CST(1235閱讀)
$topictext 轉位子(transposable elements)會影響人類基因的轉譯序列、剪接位置以及轉錄調控,轉位子的片斷已經在許多的組織與腫瘤細胞中被偵測到。

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