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Bioinformatics Knowledge Database 國網中心生物知識庫與生物計算服務系統: 期刊導讀

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小鼠胚胎轉錄體整合性分析
貼出者為 TerryYeh 於Tuesday, July 31 @ 15:39:54 CST(1450閱讀)
$topictext 監控全域的基因表現提供了一個觀看基因與調控訊息如何協同工作,引導胚胎發育的機會,現今發育生物學以及畸形學領域,面臨了一個需要自動存取基因表現特徵參考資料庫的需求,能夠測試胚胎轉錄體的遺傳與環境調控。

排列排比的多序列排比法
貼出者為 TerryYeh 於Tuesday, July 31 @ 13:51:50 CST(1448閱讀)
$topictext 動機:多序列排比是生物資訊領域中的基礎工作,目前的工具通常都是由合併次級排比(subalignment)作為排比的初始,之後便是重複拆解及合併次級排比來潤飾這個排比,即可以得到一個改進過的最終排比結果。

蛋白質體資料交換與儲存:通用標準與公開儲存的需求
貼出者為 TerryYeh 於Thursday, July 26 @ 10:34:08 CST(1363閱讀)
$topictext 經由全世界各實驗室產生的蛋白質體資料一直增加,導致了在資料儲存與取得上有了重大的問題。

序列相似性與功能相似性間的定量評估
貼出者為 TerryYeh 於Monday, July 23 @ 16:36:04 CST(1433閱讀)
$topictext 背景:於基因體註解時,進行新蛋白質的註解,往往都採比較序列相似性的方法做未分析的第一步,然而序列的比較可能會導致功能指派錯誤的產生,因此,進行系統性的大規模以序列為基礎的功能指派分析是很重要的。

自動取出多序列排比的信賴區域
貼出者為 TerryYeh 於Wednesday, July 18 @ 15:42:24 CST(1139閱讀)
$topictext   背景:利用基因體註解轉換至另一個基因體,採用高品質的多序列排比是具決定性的,多序列排比方法為了要達成增加測試組的平均正確性,往往會忽略掉序多單一排比的正確性。

一種以文法為基礎的比對演算法
貼出者為 TerryYeh 於Wednesday, July 11 @ 10:57:01 CST(1294閱讀)
$topictext 當基因體定序的成本逐漸下降,大量的序列比較幾乎可以讓我們了解演化與基因的功能,快速的基因體比對佔據了未來生物研究一個重要的角色。

基因調控:發育時期的基因控制網路
貼出者為 TerryYeh 於Thursday, June 28 @ 10:41:54 CST(1526閱讀)
$topictext 在發育中生物體內最基礎的工作就是要控制數以千計的基因表現,這需要龐大的計算資源來平行處理許多不同胚胎細胞中大量調控的輸入,以及反應調控特定組織的輸出...

一個生物網路的網頁發佈工具
貼出者為 TerryYeh 於Tuesday, June 26 @ 14:10:35 CST(1427閱讀)
$topictext 背景:細胞的發展取決於細胞內分子網路的功能,而針對特定生物路徑的文獻確認,對於理論與實驗研究團隊及社群是非常重要的,目前沒有工具可以用來發布及設立的一個使用者定義的大尺度註解路徑圖表。

計算代謝網路拓樸、穩定及動態的電腦方法
貼出者為 TerryYeh 於Tuesday, June 26 @ 11:57:08 CST(1217閱讀)
$topictext 細胞代謝可以利用一個複雜的生化流量、代謝化合物以及調控交互作用的網路來描述

神經功能系統生物的漫長旅程
貼出者為 TerryYeh 於Tuesday, June 26 @ 11:02:00 CST(1208閱讀)
$topictext 計算神經生物學的發展大約起源於五十年前,自始以來就一直是生物學模型中居於最前線的地位

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