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GCG (Genetics Computer Group)是生物資訊界最廣為人知的分子序列分析軟體套裝。最初是在美國威斯康辛大學麥迪遜校區(University of Wisconsin-Madison)內發展,最後脫離出來成為一家公司,其間曾經是Oxford Molecular 的分支機構,目前GCG由Accelrys公司所併購,命名為Accelrys GCG ,於2005年底更新版本為11版。

GCG 套裝包括了超過130 個分析程式,可以分成序列比對、資料庫搜尋、演化分析、限制酶裂解圖譜、特殊序列片段辨識、PCR引子設計、蛋白質分析、核酸二級結構、轉譯等類別;除了分析程式外,GCG同時也提供多種生物資料庫,例如:核苷酸相關的GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、RefSeq (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/),蛋白質相關的GenPept (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、PIR-Protein (http://pir.georgetown.edu/)、UniProt (http://www.pir.uniprot.org/)、PROSITE (http://au.expasy.org/prosite/)、Pfam (http://pfam.wustl.edu/),以及REBASE等資料庫。使用者可以輸入自己實驗的分子序列,或是從這些資料庫取得分子序列,再利用GCG 套裝分析軟體分析這些序列。使用者可經由網際網路連線的方法使用GCG套裝分析軟體及資料庫。

執行GCG套裝分析軟體可分為三種方式:1.傳統的文字指令模式 2.SeqLab的X視窗介面 3. SeqWeb網頁瀏覽器介面。國網中心所提供之GCG服務以SeqWeb網頁介面為主。

GCG/SeqWeb使用教學

歡迎使用國家高速網路與計算中心提供之GCG(SeqWeb/SeqLab)服務,目前本中心提供之 Accelrys GCG/SeqLab為 11.1.2版,SeqWeb版本3.1.2版,資料庫的部份版本更新為Release 2008-3(June 2008),詳細內容如下:

                              Welcome to GCG
                           Version 11.1.2-UNI
                           Installed on linux
                	Copyright (c) 1982 - 2006, Accelrys Inc.
                             All rights reserved.
          Published research assisted by this software should cite:
              GCG Version 11.1, Accelrys Inc., San Diego, CA
              Databases available:
                GenBank               Release  165.0   (04/2008)
                GenPept               Release  165.0   (04/2008)
                Refseq                Release  28.0    (03/2008) 
                UniProt               Release  13.2    (04/2008)
                PROSITE               Release  20.31   (04/2008)
                Pfam                  Release  22.00   (06/2007)
                Restriction Enzymes (REBASE)   804     (04/2008)
     Technical support see: http://www.accelrys.com/support/ 
	 Online help: % genhelp or http://www.accelrys.com/support/bio/genhelp/

3.0版服務網址http://bioinfo2.nchc.org.tw/

或由國網中心生物資訊系統網頁http://bioinfo.nchc.org.tw/ 進入SeqWeb即可!!

使用者若有任何3.0版使用問題,請E-mail至TerryYeh@nchc.org.tw!!謝謝!!

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