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生物資訊服務說明

生物資訊服務系統的服務對象主要為具備生物及生物資訊學基礎的使用者,提供生物序列分析軟體及資料庫、生物晶片分析軟體、結構生物軟體以及生物影像軟體服務。

生物序列分析軟體及資料庫
我們提供了各種不同功能與用途的序列分析工具與軟體套組,從最基礎的NCBI Web-BLAST、到生命科學研究人員最常用的GCG/SeqWeb生物序列分析軟體套組、EMBOSS序列分析軟體套組、整合性序列分析入口SeWeR,以及BioTeam iNquiry生物資訊分析軟體,上述軟體使用者只需要透過本生物資訊服務系統網站,申請使用者帳號和密碼,即可使用上述的生物資訊軟體。
由於生物序列資料庫相當的多元,有核酸序列資料庫(GenBank、RefSeq、EMBL)、蛋白質序列資料庫(SwissProt、PIR、TREMBL)以及蛋白質結構資料庫(PDB)等等,而各種資料庫分別由不同的研究機構所維護,所以在過去資料查詢必須連線至各資料庫網站進行搜尋,因此為了讓資料庫搜尋能有一個統一的入口,SRS(Sequence Retrieval System)便因此而生。

生物晶片分析軟體
由於生命科學研究人員對基因晶片分析的需求,業界以及學術界都推出許多基因晶片相關的分析應用軟體,從單純進行影像處理、正規化、差異性表現分析、叢集分析或是資料庫軟體,到彙整多項功能的整合性軟體都有。國網中心提供的生物晶片分析軟體為BASE(BioArray Software Environment)。

結構生物軟體
結構生物學為生命科學中重要的一個分支,主要目的為探討生物巨分子之複雜結構特性、形成此結構之動力過程、以及分子結構與其生化功能之間的關係。近年由於計算機之快速發展,以及生化資料庫中實驗數據的累積,使高速計算在結構生物學研究中扮演的角色越趨重要。因此,國網中心亦提供結構生物相關軟體供研究人員使用。

生物影像軟體
在生物醫學的研究當中,常常會產生出許多的生物醫學影像,諸如電腦斷層掃描、核磁共振影像、顯微鏡影像等,以往對影像的分析與判讀,都是透過醫生或生醫研究人員的肉眼進行,而由於電腦技術的進步,利用電腦來輔助生物影像分析及3D影像重建,已經成為現今進行生醫研究的趨勢。 目前我們與清華大學腦科學研究中心合作建立果蠅大腦3D影像資料庫,使用者可以透過網頁,依研究需要重組影像模組,進而觀察腦神經叢與神經網路在立體空間的關係